시카고에서 교통사고로 병원에 실려온 마크는 지문 조회로 뉴욕의 살인 사건 용의자임이 드러나 호송 비행기에 오른다. 다른 죄수들을 감시하던 연방보안관 샘 제라드는 기내에서 마크를 노린 총격이 벌어지고 비행기가 추락하는 참사에 휘말린다. 혼란 속에서 마크가 탈출하자 제라드는 팀을 이끌고 수색에 나서며, 정부 요원 존 로이스도 수사에 합류한다. 그러나 도망자는 평범한 범죄자와 달리 훈련된 움직임과 판단으로 추적을 피한다. 마크가 자신을 노리는 사람들의 흔적을 찾아 움직이는 동안 제라드는 사건 자료와 현장에서 드러나는 사실 사이의 어긋남에 주목한다. 무슨 일이 있어도 도망자를 붙잡겠다는 집념은 이제 그를 누가, 어떤 이유로 먼저 없애려 하는지 알아내야 하는 수사와 맞물린다.